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华盛顿大学教授要3D扫描地球上所有现存鱼类

童程童美 2017-01-18

在美国华盛顿大学,有一位教授正在致力于一项宏大的工程,他希望能够亲手3D扫描和数字化这个星球上近25000种现存的鱼类。这意味着在网络上将很快出现每种鱼的高分辨率3D数字模型供所有人免费下载。

摘要

在美国华盛顿大学,有一位教授正在致力于一项宏大的工程,他希望能够亲手3D扫描和数字化这个星球上近25000种现存的鱼类。这意味着在网络上将很快出现每种鱼的高分辨率3D数字模型供所有人免费下载。

华盛顿大学教授要3D扫描地球上所有现存鱼类

这个人就是该校的生物学与水产渔业教授Adam Summers。他目前正在华盛顿大学的星期五港实验室(Friday Harbor Laboratories)使用小型计算机断层扫描(CT)仪对从世界各地收集来的鱼类标本进行扫描。这台设备有点像医院里使用的标准CT设备:从不同的角度拍摄一系列X射线图像,然后借助计算机生成其骨架的3D模型。

这个项目的是希望能够帮助科学家们研究某一特定物种的形态,或者试着理解为什么一群鱼儿都有相似的物理特征,比如其骨质的“头盔”或者能够埋入沙子的能力等。

“而且当把这些数据放到网络上后,看到有人在使用它也很让我开心。”Summers说。

因为直到现在,科学家们要获得一个动物的详细3D扫描仍然不是一件简单——或者低成本——的事情。Summers就曾经不得不祈求医院帮他扫描几种标本,其中包括一只,这只魟的CT扫描图像在2000年首次出现在一份生物学杂志的封面上。

这么多年来,Summers和同事们已经开发出了更加有效的方式可以在医院 大批量地扫描标本,但每次扫描的成本仍然非常昂贵——从500美元至2000美元不等。

最终,Summers一咬牙筹集了34万美元于去年11月份购买了一台这样的扫描设备,并将其放在了星期五港实验室里开放给所有人使用。他的政策是任何人都可以免费使用它,但是鱼必须是来自博物馆的收藏品。

华盛顿大学教授要3D扫描地球上所有现存鱼类

于是,世界各地的学生、博士后研究人员和教授都来到了位于圣胡安岛(San Juan Island)的Summers的实验室,来扫描他们最喜欢的标本。有的时候他们还会寄来带鱼类标本的盒子委托Summer的实验室进行扫描并发布在网上。这些来自博物馆的鱼类标本可以通过其编码进行追踪。迄今为止,Summer的在线数据库里已经收录了来自华盛顿大学Burke自然历史与文化博物馆、美国国家科学院、俄亥俄州立大学、西澳大利亚博物馆等许多机构收藏的鱼类表面的3D扫描数据。

大多数科学家在使用鱼类的3D数据时往往对于其形态测量数据更加感兴趣三维鱼——比如某根特定骨头的长度——或者寻找以前从未见过的一个解剖面等。而数字化扫描结果可以使您从不同的角度观察,或者进行放大,甚至将其3D打印出来。

据了解,Summers如今在通过一次扫描多个鱼标本来加快他数字化全球鱼类的过程。他会像墨西哥卷饼那样将几个标本包在一起装到一个圆筒里然后直接放在扫描仪里面。机器扫描完毕之后,Summers再通过软件将这些鱼分离开来生成不同的3D文件。

此外,他也不会以最高的分辨率进行扫描,因为实际上很少有科学家需要如此详细的数据,而且这也可以节省更多的时间和数字空间,并使人们更容易通过网络获得这些文件。

华盛顿大学教授要3D扫描地球上所有现存鱼类

到目前为止,Summers的团队已经扫描了大约515个物种,其中大部分都已经通过开源分享学术项目的网站Open Science Framework发布了出去。Summers预计要完成世界上所有鱼类的扫描大约需要两年半到三年的时间。

而Summers的下一步计划是完成对地球上所有5万种脊椎动物的3D扫描——他认为使用6台像他现在使用的那种CT扫描仪就可以在几年内完成这一壮举。